En los últimos 50 años los patólogos mexicanos han estado representados por la Asociación Mexicana de Patólogos, A.C con sede en la ciudad de México; con el devenir de los años se fueron desarrollando diversos grupos de la especialidad  en  otras ciudades o regiones del país: “ los patólogos del noreste, los del centro, los del noroeste”, etc. 

A finales de los años setenta se vislumbró la creación de una federación y se estudió la posibilidad en el seno de la Asociación Mexicana de Patólogos; dicha posibilidad no progresó (Boletines de la AMPAC 4,5 y 55). No obstante en los siguientes 20 años, se siguieron formando nuevas asociaciones, sociedades y colegios; asimismo programas de residencia en anatomía patológica en algunas ciudades del país.

En 1999 un grupo de patólogos representantes de diferentes agrupaciones del país iniciaron un grupo de trabajo formal con la finalidad de que expusiera a la comunidad la necesidad de contar con una organización de representación gremial nacional que agrupara con equidad y democracia a las diferentes asociaciones, sociedades y colegios de Anatomía Patológica. La idea fue analizada y discutida  por dicho grupo y luego planteada a la comunidad en la reunión nacional de Chihuahua en mayo de 1999. La idea fue aceptada y se nombró una comisión que estudió la viabilidad del proyecto, el apoyo por la mayoría de las agrupaciones de patólogos y la elaboración de un cuerpo estatutario.

En mayo del 2000 se convocó a una reunión en Torreón de presidentes y delegados de las diferentes asociaciones y colegios, durante la reunión nacional en la cual se nombró un consejo directivo, se aprobaron los estatutos enviados meses atrás a las asociaciones y colegios locales y regionales interesados en el proyecto y finalmente la federación se constituyó legalmente en la ciudad de San Luis Potosí el 24 de noviembre del 2000 en el  marco del Seminario Tomás Velásquez.

La primera reunión nacional de delegados se realizó en la ciudad de Acapulco, Gro. en mayo de 2001 también durante el congreso nacional.  Recientemente nos hemos enterado de la creación de nuevos colegios de patólogos, que participarán activamente en la federación, bievenidos